Immun-Co-sedimentation-Experimente

RNA-gebundene DNA-Protein-Interaktion: CHIRP

Immun-Co-sedimentation-ExperimenteChromatin Isolation by RNA Purification (CHIRP) ist eine Methode zur Erkennung der Wechselwirkungen von DNA und Proteinen im Körper, die an RNA gebunden sind, und zur gleichzeitigen Analyse der Wechselwirkungen zwischen IncRNAcircRNA, Proteinen und DNA.

CHIRP experimentelle Bedeutung

IncRNA kann mit Proteinen, DNA und RNA interagieren, um eine Vielfalt von Funktionen zu erreichen, und CHIRP kann die Funktion und die Wirkungsmechanismen von Proteinen untersuchen, mit denen IncRNA interagiert. Die Forschung über IncRNA spielt eine wichtige Rolle bei Lebensaktivitäten wie der epigenetischen Regulierung und CHIRP

IncRNA ist ein wichtiges technisches Mittel zur Identifizierung und qualitativen, quantitativen und lokalisierenden Analyse der Wechselwirkungen zwischen RNA und Chromatin im gesamten Genom.

Das CHIRP-Experimentprinzip

CHIRP (Chromatin Isolation by RNA Purification) ist eine Nukleinsäuresonde, die das Biotin bindet und das Ziel-RNA abzieht, mit dem die zusammenwirkenden DNA-Chromosomenfragmente (DNA-Proteinkomplexe) adsorbiert werden und die RNA. DNA und Proteine können durch qRT-PCR. WB. Sequenzierung und Massenspektrometrie nachgewiesen werden.

Der experimentelle Prozess von CHIRP

① Sondenentwurf: Entwurf der Nukleotidsonde:

Zellkultur;

Zerbrochene Zellen:

Biotin-markierte DNA-Sonden mit RNA-Hybriden;

⑤ CHIRP;

Extraktion von RNA, DNA und Nukleinsäurebindeproteinen; .

Analyse der Prüfung. ,

Ergebnisse anzeigen

Fertigstellungszyklus und Lieferkriterien

1. Versuchszeitraum: 1-3 Monate

2. Lieferkriterien: CHIRP-Erkenntnisbericht, Analysebericht, Versuchsbericht (Reagenzien, Verbrauchsmaterialien, Versuchsschritte), Rohdaten usw.

Informationen, die mit dem Kunden bestätigt werden müssen

Gen- und Proteininformationen zum Zweck.

2. Typ und Gattung der Probe

3. Bedarf an einer Analyse

Referenzen

[1]lyer S, Modali S D, Agarwal S K. Die lange nicht-kodierende RNA MEG3 ist ein epigenetischer Determinant der onkogenen Signalisierung in funktionellen Pankreasneuroendokrinen Tumorzellen [J]. Molekuläre und Zellbiologie, 2017: MCB.00278-17.

[2] Chu C, Chang H Y. Verständnis von RNA-Chromatin-Interaktionen unter Verwendung von Chromatinisolierung durch RNA-Reinigung (ChIRP). [J]. Methoden in der Molekularbiologie, 2016, 1480.

[3] ZhuJJ, FuHJ, Wu Y G, et al. Funktion von IncRNAs und Ansätze zu IncRNA-Protein-Interaktionen [J]. Wissenschaft

China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.

Einige Experimente als Dienste