Kann das Massenspektrum für die Sequenzierung von Proteinen verwendet werden?

Kann das Massenspektrum für die Sequenzierung von Proteinen verwendet werden?Testtechnik Service Details

I. Hintergrundvorstellung

Die Sequenzierung von dànbáizhì kann die Aminosäuresequenz von dànbáizhì direkt aufdecken, die die Grundlage für das Verständnis der Struktur und Funktion von dànbáizhì ist. Nach der Sequenzierung des Proteins kann die dreidimensionale Struktur von dànbáizhì weiter vorhergesagt werden und dann seine biologischen Funktionen und Wechselwirkungsmechanismen analysiert werden. Dies ist wichtig, um die Geheimnisse der Lebenstätigkeit aufzudecken und das Auftreten und die Entwicklung von Krankheiten zu verstehen. Derzeitige Protein-Sequenzierungstechniken sind hauptsächlich: Massenspektrum-Sequenzierung von Anfang an, Edelman-Abbau und Nanoporsequenzierung. Derzeit ist die häufigste Anwendung auf der Basis der Massenspektrum dànbáizhì von Anfang an Sequenzierung. De novo Protein Sequencing (DE NOVO PROTEIN SEQUENCING) ist eine neue Sequenzierungstechnik, die sich auf keine bekannten Sequenzen oder Informationen aus der dànbáizhì-Datenbank stützt und direkt die dànbáizhì-Aminosäuresequenzen bestimmt, was besonders bei der Identifizierung neuer Proteine wichtig ist. Antikörper sind als Moleküle des bìbùkěshǎo in unserem Immunsystem ein wertvolles Werkzeug in der medizinischen Diagnose und Therapie, und die Sequenzierung von Grund auf hat wichtige Anwendungen im Bereich der Antikörper.

II. Technischer Prozess

Die Massenspektrometrie basierende dànbáizhì-Sequenzierung ist die Verwendung eines Massenspektrometers zur Erfassung von Qualitätsinformationen über die Aminosäuresequenzen der Peptidensegmente, d. h. das Sekundärspektrogramm, um die Peptidensequenzen direkt aus dem Sekundärspektrogramm durch einen Sequenzierungsalgorithmus von Anfang an zu analysieren und nach dem Sequenzspitzen die vollständige dànbáizhì-Aminosäuresequenz zu erhalten. Der technische Prozess der Sequenzierung von zhìpǔfǎdànbáizhì ist wie folgt: Probenvorbereitung → dànbáizhì Enzymase → Peptidensegmentisolierung → Massenspektrometrie → Datenanalyse. Die Dinge, die zur Aufmerksamkeit gezogen werden müssen, in der Sequenzierung von zhìpǔfǎdànbáizhì sind: ① während der Probenvorbereitung, versuchen Sie, den Abbau von dànbáizhì zu vermeiden; ② Auswahl des geeigneten Enzyms für die dànbáizhì Enzymolyse; Stellen Sie sicher, dass die Leistung des Massenspektrometers stabil ist und verbessern Sie die Genauigkeit der Daten.

III. Studien

Monoklonale C-Globulinose (MGUS) ist eine Plasmazellerkrankung, die durch die Präsenz eines primären monoklonalen Antikörpers (d. h. M-Protein) im Serum gekennzeichnet ist. Die Autoren untersuchten das IgG1-M-Protein im menschlichen Serum durch eine Flüssigchromatografie-Massenspektrometrie-Koppanalyse. Das M-Protein wurde mit mehreren Proteasen enzymatisch geschnitten, Antikörper-Peptidensegmente wurden mit einer von Anfang an sequenzierten Methode analysiert, und nach dem Peptidensegment-Spleizen ermittelte zuì schließlich die schwere und leichte Kettensequenz des vollständigen M-Proteins. Darüber hinaus charakterisierten die Autoren die Glykoxylierungsspiegel in der CDR-Region des Antikörpers.

Die Sequenzierung des Massenspektrums dànbáizhì hilft bei der Entdeckung neuer Arzneimittelziele und liefert wichtige Informationen für das Design und das Screening von Arzneimitteln. Durch Sequenzierungstechniken können Wissenschaftler die Krankheitsbezogenen dànbáizhì identifizieren und Medikamente für diese dànbáizhì entwerfen, um eine jīngzhǔn-Behandlung zu ermöglichen. Mit der dànbáizhì-Sequenzierungstechnik können Ärzte den Krankheitszustand des Patienten besser bewerten, den Fortschritt der Krankheit vorhersagen und so ein individuelleres Behandlungsprogramm entwickeln. Dies verbessert nicht nur die Wirkung der Behandlung, sondern reduziert auch die Nebenwirkungen und verbessert die Lebensqualität des Patienten.

Basierend auf der Literatur, die in Nature Biotechnology und der Proteomik-Zeitschrift JPR von zhuānyè veröffentlicht wurde, hat Beijing Baitai-Pak Biotechnology Co., Ltd. eine Software für die Analyse von Antikörper-Sequenzen entwickelt, die mit dem vorhandenen Hintergrundwissen von zhuānyè kombiniert ist. Die Methode zur Berechnung von Rohdaten des Massenspektrums wurde selbst untersucht und das Prinzip der Breite und Enge verwendet, um die genaue Identifizierung von Antikörper- / Protein-Sequenzen zu erreichen, ohne keine effektiven Dateninformationen zu verpassen. Bei der Sequenzierung werden die Massenspektrometer Orbitrap Eclipse und Orbitrap Fusion Lumos mit hoher Auflösung und Empfindlichkeit verwendet, um die Qualität der Daten und die Genauigkeit der Ergebnisse zu gewährleisten. Der Protein/Antikörper-Sequenzierungszyklus dauert 3 bis 4 Wochen.

4. Literaturreferenzen

Albert, Denboer, Arjand, et al. Direkte Massenspektrometrie-basierte Detektion und Antikörper-Sequenzierung von Monoklonaler Gammopathie von unbestimmter Bedeutung aus Patientenserum: Eine Fallstudie. Journal of Proteome Research, 2023, 22(9): 3022-3028.

[2] Bandeira N, Pham V, Pevzner P, et al. Automated de novo protein sequencing of monoclonal antibodies [J]. Natur Biotechnologie, 2008, 26(12):1336-1338

Besondere Biotechnologieprojekte von Betypake

1. Protein Sequenzierung

Mit dem neu eingeführten Obitrap Fusion Lumos Massenspektrometer von Thermo und dem Edman Degradation Sequencing System von Shimazu bietet PT Biotech eine Protein-Sequenzierungsanalyse auf Basis von Massenspektrum, einschließlich der Analyse der Aminosäure-Zusammensetzung von dànbáizhì, der Nduāncèxù-, Cduāncèxù- und Vollsequenzanalyse sowie der dànbáizhì-N-End-Sequenzanalyse auf Basis von Edman Degradation. Für die dànbáizhì unbekannter theoretischer Sequenzen wird ein dànbáizhì-Sequenzierungsdienst auf der Grundlage der Zero-Sequenzierung zur Analyse der Proteinsequenzen angeboten.

*Vorteile:

1. Mit dem weltweit fortschrittlichen Massenspektrometer Obitrap Fusion Lumos;

100% Abdeckung der ermittelten Zielproteinsequenz;

Bestimmbar Protein N-End bis zu 70 Aminosäuresequenzen;

Proben in verschiedenen Formen bestimmbar: Proteinlösung, PVDF-Proteinband;

5. Niedrige Probenverbrauchung: Proteinproben benötigen nur 5-10ug, um den Test abzuschließen;

Sequenzierung ist nicht von N-End-Modifikationen wie N-End-Schließung, PEC und Glykoxylierung beeinflusst.

II. dànbáizhì Gruppenlehre

Die Orbitrap Fusion Lumos-Plattform von Thermo Fisher wird mit Nano-LC kombiniert, um eine Vielzahl von analytischen Diensten für Quantitative dànbáizhì-Omik, Targeted dànbáizhì-Omik, Polypeptide-Omik und post-translationale modifizierte Proteomik bereitzustellen. Darüber hinaus hat PT Biotech einen neuen 4D dànbáizhì-Omik-Dienst auf der Grundlage von timsTOF Pro eingeführt, der Forschungsarbeiten in den Bereichen Spurprobenproteomik, Medizin mit großen Probenpopulationen und Hochdurchflussmodifikationsomik unterstützt.

*Vorteile:

1 . Quantitative Proteinanalyse mit hohem Durchsatz: Massenversuchungsanalyse in mehreren Kontrollgruppen zur Entdeckung neuer Biomarker;

2. in vivo und in vitro verschiedene dànbáizhì-Markierungsmethoden, die für die Analyse von Gewebe, Zellen, Blut und anderen Proben geeignet sind;

3. hohe Empfindlichkeit der Massenspektrumanalyse und hohe Wiederholbarkeit der Experimentergebnisse;

4. kann niedrigere Fülle von Proteinen erkennen, breiter linearer Bereich;

5. zhuānyè bioinformatische Analyse, die Analyse ist systematisch genauer.

Technische Analyse des Einzelzell-Massenspektroms

Prototype Biotechnology verwendet das Fluidigm-Massenspektromsystem für die einzellige Massenspektromtechnikanalyse, die die Zelloberfläche und das Innere der Moleküle mit Metallelementmarkern (in der Regel spezifischen Antikörpern, die mit Metallelementen gekennzeichnet sind) kennzeichnet, anschließend einzelne Zellen mit dem Stream-Zellprinzip trennt und anschließend das Atommassenspektrum einzelner Zellen mit der induktiv gekoppelten Plasma-Massenspektrometrie (ICP-MS) analysiert, zuì konvertiert die Atommassenspektromdaten in den signalisierenden molekularen Ausdruck auf der Zelloberfläche und im Inneren.

*Vorteile:

Technologiefortschritt, um technische Lücken zu füllen

Durch die Verwendung von Metall-markierten Antikörper-Technologien wird das Problem vermieden, dass herkömmliche Fluoreszenzkanale wenig und leicht miteinander beeinflusst werden. Mit der gleichzeitigen Charakterisierung mehrerer Indikatoren auf Einzelzellebene können 51 Zielproteine gleichzeitig nachgewiesen werden.

2. Große Anzahl von Analysen, niedrigere Kosten

Einzellige RNAseq ist durch Kosten und andere Faktoren eingeschränkt, die Anzahl der Analysen aller Probenzellen ist in der Regel etwa 2x10 ^ 4, während die Stream-Massenspektrometrie auf einmal (eine einzige Probe) mindestens 10 ^ 5 Zellen analysieren kann, um eine quantitative Verbesserung zu erzielen, und die Kosten sind nicht höher als die Einzellige RNAseq.

3. Große Anwendungsaussichten

① Die Ergebnisse des Stream-Massenspektrums können Veränderungen in der Zelltubpopulation geben und haben große Forschungsaussichten in Bezug auf die klinische Diagnose und die Erkrankungsmechanismusforschung;

Die Kombination von Metalletikettentechnologie mit anderen Technologien wird eine neue Anwendungsrichtung geben. Neben herkömmlichen Proteinen kann die Massenspektromzelltechnik auch für die Proteinmodifikation nach der Translation verwendet werden;

Sie können die Überlebensrate der Zellen, die Zellgröße, die mRNA-Transkriptor-Expression, die Geschwindigkeit der DNA-Synthese und die Protease-Aktivität erkennen.

Immunopeptidomische Analyse basierend auf hochpräzisem Massenspektrum und Entdeckung neuer Antigene

Die One-Stop-Lösung für die Immunopolypeptidomik-Analyse und die Entdeckung neuer Antigene auf der Grundlage eines hochpräzisen Massenspektrums von PT Biotech umfasst unsere patentierte, hochempfindliche Lösung zur Anreicherung und Identifizierung von Immunpeptiden. Wir unterstützen Sie bei der Identifizierung und Identifizierung von mehr als 10.000 Polypeptiden Typ I und 10.000 Polypeptiden Typ II. Immunpeptidomische Analysen mit unserer optimierten Hochdurchfluss-Immunpeptidomischen Analyseplattform ermöglichen wiederholbare Identifizierung und Quantifizierung aus zuì-kleinem Probenmaterial. Der Dienst kann auf großflächige Forschungen angewendet werden und soll Forschern helfen, Lösungen für Krebs, Immunerkrankheiten und Infektionskrankheiten zu finden und unbekannte Ziele zu erforschen.

V. Biologische Charakterisierung

Batepack basiert auf der hochauflösenden Massenspektrometrie-Technologie, MALDI TOF， Hocheffiziente chromatografische Trennungstechnologie, die eine Reihe von wánshàns Biopharmazeutische Analyse-Lösungen bietet, von der Aminosäure-Zusammensetzung und Strukturanalyse von Bioprodukten wie dànbáizhì, Polypeptiden, Antikörpern und Impfstoffen bis hin zur Analyse der Produktvariabilität und Reinheit. Ziel ist es, qualitativ hochwertige biopharmazeutische Analysedienste zur Verfügung zu stellen, um den Herstellern von Biopharmazeutika zu helfen, die Qualität von Biopharmazeutika zu verbessern.

Die sieben Testplattformen von Biotech

Biotech - Bioproduktcharakterisierung, Biomassenspektrometrie

Beijing Baitai Pak Biotechnology Co., Ltd. widmet sich der Bereitstellung von Zhuānyè-Dienstleistungen wie Qualitätskontrolle-Prüfung und Projektvalidierung für die Bio- / Pharma- und Medizingeräteindustrie. Das Labor des Unternehmens folgt den Vorschriften und Leitlinien der NMPA, ICH, FDA und EMA und hat durch die Zertifizierung des doppelten Qualitätssystems CNAS / ISO9001 ein vollständiges Qualitätssystem eingerichtet, Daten kalt-heiß / außerhalb des Ortes sichern, Geräte regelmäßig messen / während der Überprüfung, Software-Audit-Tracking, um Kunden integrierte Lösungen und technische Dienstleistungen zur Unterstützung der Forschung und Entwicklung neuer Arzneimittel, der Registrierung von Arzneimitteldeklarationen und der Freigabe der Produktion.

1. Das Unternehmen nimmt das Qualitätskontrollsystem ISO9001 an, zhuānyè bietet CRO-Testanalysedienste auf der Basis von Massenspektrum an;

2. durch das nationale CNAS-Labor anerkannt, um Kunden medizinische Qualitätsforschungsdienstleistungen zu bieten, die den globalen pharmazeutischen Vorschriften entsprechen;

3. Die Geschäftsbereiche umfassen dànbáizhì-Omik, Polypeptidomik, Metabolomik, Biopharmazeutische Charakterisierung, Einzelzellanalyse, Einzelzellmassenspektrometrie, Bio-Cloud-Analyse und Multi-Student-Massenspektrometrie-Integrationsanalyse;

4. sieben Qualitätskontrolle-Prüfplattformen, um Ihre One-Stop-Service-Anforderungen zu erfüllen;

5. Service 3000 + Unternehmen, 10000 + Kunden Auswahl;

6. Engagiert, Ihnen qualitativ hochwertige Biomasse-Spektrum-Analyse-Services zu bieten!

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