Ribo-seq Technische Dienstleistungen

Ribo-seq Technische Dienstleistungen

Technische Grundsätze

Proteine sind der Hauptträger der Lebensaktivität, und die Übersetzungsregulierung ist eine wichtige Regelung innerhalb der Zelle. Translation ist der Prozess, bei dem Ribosomen mRNA-Vorlagen lesen, um die Proteinsynthese zu leiten, und ist ein entscheidender Schritt bei der Genexpression. Der Übersetzungsprozess ist streng reguliert und viele Krankheiten sind mit Übersetzungsabweichungen verbunden, wie neurodegenerative Erkrankungen, Anämien und Entwicklungsstörungen. Obwohl die Struktur und Funktionalität der Ribosomen gründlicher untersucht wurden, müssen auch die Mechanismen der Regulierung des Übersetzungsprozesses vertieft untersucht werden.

Ribosomenprofilierung (Ribosome Profiling)Ribo-SeqSie können den Zustand der Übersetzung im Körper genau erkennen.Ribo-SeqDer Kern der Technik besteht darin, die mRNA zu identifizieren, die an Ribosomen gebunden ist, sowie etwa 30 Nukleotide, die translatiert werden. Die Sequenzierung von Ribososom-gebundenen mRNA-Fragmenten ermöglicht die genaue Aufzeichnung der Position des Ribososoms während der Translation. Transkriptionsgruppe undRibo-SeqDie gemeinsame Analyse der Daten ermöglicht die Berechnung der Geschwindigkeit der Proteinsynthese.

Technische Merkmale

Ribo-SeqEs kann die Zeit, den Ort, den Ort der Proteinsynthese, welche Proteine synthetisiert werden und die Regulierungsmechanismen der Proteinsynthese offenbaren.Ribo-SeqDie Brücke zwischen der Transkriptomie und der Proteomik wurde in der Forschung von Tieren, Pflanzen und Mikroben weit verbreitet, um die Regulierungsmechanismen der Wachstumsentwicklung, der Morphologie, des Auftretens von Krankheiten und der Zwangsreaktion auf Widerstände aufzudecken.

Anwendungsrichtung

Ribo-SeqAnwendung zur Untersuchung der Translationsaktivität von Transkripten, zur Identifizierung von Translationsbeginnstätten, ORF-Positionen und Translationsregulatorischen Mechanismen von Proteinen.

Ribo-SeqDie Technologie wurde in der Forschung von Tieren, Pflanzen und Mikroben weit verbreitet, um die Regulierungsmechanismen der Wachstumsentwicklung, der Morphologie, des Auftretens von Krankheiten und der Zwangsreaktion auf Widerstände aufzudecken. Allerdings,Ribo-SeqSie können den Zustand der Translation von Proteinen auf genomischer Ebene erkennen, Informationen über die translatierten mRNA-Sequenzen erhalten und die Mechanismen der Translationsregulierung analysieren.

Vorteile von Blue Vision

Experimentelle Zyklen sind schnell, qualitativ hochwertig und die Ergebnisse stabil und zuverlässig.

Reiche Artenerfahrung.

Ribo-seq Technische DienstleistungenVersuchsablauf

Inhalte analysieren

Standardlebensanalyse

(1) Rohdatenfilterung und Sequenzierungsqualitätsbewertung

(2) Vergleich der Entfernung von Ribosomal-RNA, tRNA, sRNA usw.

(3) Reads Längenverteilungsstatistik und Längenfilter

(4) Vergleich der Referenzgenome

(5) Sequenzierung Sättigungsanalyse

(6) Verteilungsstatistik und Klassifizierung von RF im Genom

(7) Dreibasis-Rhythmus-Analyse

(8) Translationsgenetische Statistik und Expressionsanalyse

(9) Probenbeziehungsanalyse

(10) Unterschiede zwischen Gruppen Translationsgenetische Analyse

(11) GO- und KEGG-Funktionsanreicherungsanalyse von Differenz-Translationsgenen

Ribo-SeqAnalyse mit RNA-Seq

1) Berechnung der Übersetzungseffizienz

Korrelation zwischen Ribo-Seq und RNA-Seq

(3) Zusammenhang zwischen Übersetzungseffizienz und Transkriptionsniveau

Analyse des Prozesses

Experimentelle Fälle

Probenanfragen

(1) Zellproben: empfohlene Probenmenge von 5 x 106-1 x 107.

(2) Tiergewebeproben: Empfohlene Probenmenge ≥ 300 mg.

(3) Pflanzengewebeproben: Empfohlene Probenmenge ≥ 500 mg.

Probengruppierung

Mindestens 2 Gruppen von Proben, einschließlich der Kontrollgruppe und der experimentellen Gruppe, mit der empfohlenen Probenzahl: 3 Vs 3.

Referenzen

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