IlluminaUnternehmen startetderMiSeq ist ein neues Sequenzmeter, das Amplifikation, Sequenzierung und Datenanalyse auf einem einzigen Gerät integriert und mehr als 1 GB Daten pro Betrieb auf einer Fläche von nur 2 Quadratfuß erzeugt. Der Prozess und die Genauigkeit von MiSeq machen es zur idealen Plattform für eine schnelle und kostengünstige genetische Analyse für eine Vielzahl von Anwendungen. Gleichzeitig wurde Illumina von der FDA in großem Umfang erworben und wird bald von der FDA zertifiziert, und im Oktober 2012 wurde der Sequenzierungsstrom des MiSeq-Systems auf etwa 8G aktualisiert. Das Upgrade wird durch zwei Aspekte durchgeführt, einer ist die Erhöhung der Cluster-Dichte, die nach dem Upgrade auf 15-17 Millionen erhöht wird, während die Anzahl der Lesungen, die von Paaren gelesen werden, auf 30-34 Millionen erhöht wird. Auf der anderen Seite ist der Durchfluss durch die Sequenzierungsleselänge erhöht, die Sequenzierungsleselänge erreicht 2 * 300 bps, während die Sequenzierungsgeschwindigkeit auch verbessert wurde. Derzeit hat das Broad Institute bereits eine Single-End-Sequenzierung mit bestehenden Reagentien mit einer Leselänge von 300 bps erreicht, und Illumina hat derzeit eine interne Sequenzierung mit einer Paar-End-Sequenzierung von 2 * 400 bps abgeschlossen. Dies wird unter der Voraussetzung hochwertiger Datenergebnisse gewährleistet.

MiSeq Leistungsparameter

Illumina MiSeq Sequenzierungszeit und Datenmenge

Illumina MiSeq Lesevergleich

Arbeitsabläufe

Illumina zweite GenerationMiSeq 4Große Eigenschaften

Kürzere Versuchszeiten: Es dauert 8 Stunden ab der Probenvorbereitung, um qualitativ hochwertige Sequenzierungsergebnisse von mehr als 100M zu erhalten.

Bequemer Probenvorbereitungsprozess: 50 ngDNA-Vorlage erforderlich, 2 Stunden automatisierter Betrieb können die gesamte Probenvorbereitung erledigen.

Sequenzierungsprinzip: MiSeq setzt das chemische Prinzip der Randsequenzierung der GA- und HiSeq-Plattformen fort.

Vollständige Integrationsfunktion: MiSeq kann die Clustergenerierung, bidirektionale Sequenzierung und Datenanalyse unabhängig durchführen, so dass Geld und Laborraum keine Hindernisse mehr für die NGS-Forschung sind.

Illumina zweite GenerationAnwendungsbereich MiSeq

1. Transkriptionssequenzierung

Die Passenor MiSeq Sequencing Platform ist eine Plattform für die Transkriptionsanalyse genomischer sequenzierter Arten. Das technische Team des Unternehmens hat die Transkriptionssequenzierung und Analyse einer Vielzahl von Pflanzen und Tieren, darunter Zebrafische, abgeschlossen.

Makrogenom 16S rDNA Single V-Zone Sequenzierung

Eine hohe Durchflusssequenzierung der einzelnen V-Zone (V3 V4) von 16s rDNA zur Identifizierung der Bakterien- und Paleontogenflora. Das technische Team von Paisennor identifizierte erfolgreich Bakterien in der Darmumgebung von Hühnern mit Illumina MiSeq zur Sequenzierung der 16S rDNA V4-Zone und in Kombination mit der Roche 454 FLX+-Sequenzierung der 16S rDNA V1 bis V3-Zonen.

Small RNA Sequenzierung

Die Leselänge von 1 * 35 bp ist mit der Sequenzlänge der kleinen RNA verbunden, die schnell und empfindlich ist. Das technische Team von Paisennor hat derzeit die kleine RNA-Sequenzierung von Gänsen und einer Vielzahl von mittelständischen Kräutern abgeschlossen.

Re-Sequenzierung: einschließlich der gesamten Genom-Re-Sequenzierung, vereinfachte Genom-Sequenzierung, Exon-Sequenzierung.

Illumina MiSeq eignet sich hervorragend für die Resequenzierung von Mikrobiomen, wobei jedes Mikrobiom jedes Mal sequenziert werden kann. Am 27. Dezember 2011 nutzte das technische Team von Paisennor MiSeq, um Milchsäurebakterien (Lactobacillus casei Zhang und Lactobacillus casei P8) mit einer 404- bzw. 213-fachen Tiefe der Genombedeckung mit einer vollständigen Abdeckung des Genoms im Vergleich zu der Referenzsequenz zu sequenzieren, während eine Vielzahl von strukturellen Variationen, einschließlich Insertionen, Fehlen und SNP-Stellen, sowie alle Plasmiden erkannt wurden.

Datenanzeige

* Die oben genannten Produktbeschreibungen und Daten stammen von Illumina und dienen nur als Referenz.Voraussetzung.