HiChIP MNase Kit 通过微球菌核酸酶 (MNase) 片段化染色质,结合邻近连接与染色质免疫沉淀,实现了在特定蛋白富集的染色质区域中,同时获取蛋白结合信息和三维互作信息,是表观遗传学、发育生物学、癌症研究、传染病等领域的核心研究工具。
HiChIP MNase KitEinzelheiten
1. Kernprinzipien und Vorteile
Technische Fusion: Die Kombination von Hi-C (Near Connection Capture Long Distance Interaction) mit ChIP-seq (Protein-DNA-Komplex-Anreicherung) ermöglicht die präzise Analyse der durch bestimmte Proteine vermittelten Chromaton-Konfiguration (z. B. Histoproteinmodifikation, Transkriptionsfaktoren).
- MNase-Fragmentierung: Ersatz für herkömmliche restriktive Endocytenzyme mit mikroskobieller Nukleatase, die gleichmäßigere Fragmentierung, höhere Auflösung und präzisere Erfassung der Chromatin-Wechselwirkungen auf Nukleosomenspiegel ermöglicht.
- Vollständiger Workflow: Die Kits bieten eine komplette Reihe von Reagentien, die von Vernetzung, Kernbehandlung, Nachbarschaftsverbindung, Immunfällung bis hin zu Bibliothekenbauen, kompatibel mit der Sequenzierung der Illumina-Plattform.
- Hohe Empfindlichkeit und Wiederholbarkeit: Optimierte Puffersysteme und magnetische Perlenanreicherungsschema, die die Erfassungseffizienz bei geringen Füllstandsinteraktionen erheblich verbessern und die Wiederholbarkeit des Experiments erhöhen.
2. Anwendungsszenarien
- Epigenetik: Analyse der durch Histoproteinmodifikationen vermittelten Chromatonringe, der Enhancer-Promotor-Interaktion.
- Krebsforschung: Analyse von anormalen Chromatoninformationsänderungen in Tumorzellen und Suche nach krebserregenden regulatorischen Wechselwirkungen.
- Entwicklungsbiologie: Untersuchung der dynamischen Veränderungen der Chromatin-Wechselwirkungen durch Transkriptionsfaktoren während der Zelldifferenzierung.
Infektionskrankheiten und evolutionäre Biologie: Analyse der Chromatinrekonstruktion nach der Infektion des Wirtes durch Pathogene oder der Evolution der Chromatinstrukturen in der Evolution der Arten.
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