Mikrobiologisches Labor umfasst in der Regel drei Bereiche: Reinigungsbereich, Betriebsbereich und sterile Zone, die in mehrere Räume wie Vorbereitungsraum, Kulturraum, Bakterienraum, Desinfektionsraum und sterile Raum unterteilt werden können. Mikrobiologische Labore unterscheiden sich je nach Fachgebiet (Umweltschutz, Lebensmittel, Pharma, Medizin usw.) und Natur (Lehre, Produktion, Forschung, Prüfung usw.), die Zusammensetzung und die Größe des Labors unterscheiden sich erheblich.