ICG als fluoreszierender Farbstoff wird häufig in der medizinischen fluoreszierenden Bildgebung verwendet. Dies liegt daran, dass das optische Fenster des Biogewebes eine größere Penetrationstiefe im Bereich von 650 nm - 1350 nm hat und im Bereich des nahen Infrarotbandes deutlich wirkt. Das primäre Absorptionsspektrum des ICG liegt zwischen 600 nm und 900 nm, während die erzeugte Fluoreszenz zwischen 750 und 950 nm liegt, mit einem charakteristischen Spitzenbereich bei etwa 810 nm Wellenlänge.ICG-Lösungen haben sich daher im medizinischen Bereich weit verbreitet. Wenn das Pulver nach sterilem Wasser gelöst ist, kann es zu einer hochkonzentrierten Injektion hergestellt werden und wird häufig für die Studie der Leberfunktion (präoperative Tests für große Leberchirurgien), die Ophthalmographie (Untersuchung der Blutgefäße und anderer Strukturen des Auges) und die Lymphmarkierung (Lymphknoten, Lymph- und Lymph-Gefäßflüssigkeiten) verwendet.